据《牡丹区通史》所载，郭秉钧生卒年月不祥，菏泽志道都（今牡丹区都司乡郭糖坊村）人，清道光年间，增广生员，后为廪生。清咸丰年间（1831年－1861年），自办团练，组成“长枪会”，任首领。清同治年间，反清起义，后参加捻军，成为捻军将领。1865年，参与了擒斩僧王的“葭密之战”。后在河南抗清战斗中牺牲。

《菏泽市志》中曾记，郭秉钧出生于道光年间，父亲郭养贤是都司郭糖坊的里长，为村中的一个富户家族，家有土地数十顷。郭秉钧少时读书，成为廪生。咸丰年间，郭秉钧成年后，继承了父亲里长的职位。为维护地方治安，自己出钱出粮，在家乡搞起了“民团”地方武装，后取名为“长枪会”，自任会长。后又被推选为菏泽东乡“长枪会”总盟主首领。

清咸丰三年（1853年），太平天国运动席卷全国，北伐军路过菏泽，并与清军作战，直接震撼了郭秉钧的心。偷偷埋藏了清军溃败时丢下的三尊大炮，以伺隙而动，准备起义。至今当地还留传有歌谣：“郭秉钧有反心，僧王大炮埋三尊。”清同治初年，菏泽各州府县又兴起捻军，势如燎原烈火。郭秉钧拳拳之心，跃跃欲试，苦于找不到借口，怕无人响应，不好起事。清同治三年（1863年），这年菏泽遭旱蝗双灾，飞蝗遮天盖地，庄稼颗粒无收，百姓苦不堪言，参加“民团”吃粮当兵者众多。郭秉钧为了筹措粮饷，卖了八顷地也难以周济，无奈向知府申请，可知府颗粒不允，更激发了郭秉钧的反清之心，他苦苦思谋。

一日夜间，他差人到埋藏大炮的地方挖了一个大坑，在炮下倒入黄豆两石，并封土浇水，五天后大炮被拱出地面。郭秉钧故作神秘，领着民团和群众来看稀奇，发现炮下还有一“神贴”，上写有“赠盟主，打曹州，开粮仓，救百姓”字样。郭秉钧看罢又故作惊讶：“快把大炮毁掉！我虽有济众之心，但无济众之才。”此时，乡亲们早已积压的怨气瞬间爆发了。纷纷跪下，大声呼喊：“郭大哥带领我们反了吧！我们尊你为大元帅。”

这时，恰巧县里衙役前来派粮，见此情景，欲回去报信，派兵捕治。可意图早已被识破，被民团抓了起来。郭秉钧问大家：“将如何处置？”“杀！”民团中刀光闪闪，声如雷震。此刻，郭秉钧抡掉长袍，站在大炮之上，大声说：“好！既然大家信得过我，我郭秉钧就从命了。今天起事，先拿这两个衙役开刀！”咚咚咚”三声炮响，郭秉钧率“长枪会”，揭竿而起，树起造反大旗，浩浩荡荡荡开出青纱帐，投奔捻军。

郭秉钧树起义旗后，以他城东方里长盟主的威望，各里长乡绅积极响应，有钱出钱，有人出人，纷纷带领人马和粮草投奔义军。队伍迅速扩大到五千多人。

咸丰十年（1860年），郭秉钧联合各县会众，达万余人，连克郓城、巨野数百寨，后攻占范县。并在运河上截夺漕船、盐船，屡败清军。后又攻占定陶、曹县等，并围攻曹州二十余日，终未克。咸丰十一年（1861年），又围攻单县城六日，又未克。自起义日，先后与僧军交战十数次，二弟、五弟先后阵亡。

一年后，转至白浮图镇(今属成武县）与清军遭遇，因清兵力超过义军数倍，敌众我寡，又遇西北强风，飞沙弥漫，结果败北。十一月，与僧军大战于红船口，又失利，郭糖坊被围。清兵数日久攻不下，后诱骗郭秉钧的三弟、四弟入寨，清军乘隙而入，结果全族遇难，母亲及兄妹被杀，后又被钉在菏泽城门上示众。

郭秉钧闻讯后，悲愤交加，誓要杀贼祭母，与清军势不两立。一日，东关泰山奶奶庙大会，郭孤身一人，扮作商人，身藏牛耳尖刀，潜藏在人群之中，摸进菏泽城，挨近东门口，见到守门武官，大喊一声：“为母报仇！”窜上一步，直刺武官前胸。等到守门清兵清醒过来，大喊“抓郭秉钧！”此时，郭秉钧已扮作和尚逃走。

后年，捻军与太平军残部联合，集结数万人之众，卷土重来，与僧军激战陈家集（今属成武县），后佯败突奔曹州，大挫县令王朝翼于葭密，并斩杀僧王。后来，起义军转移到五霸岗（今属东明县），离开曹州，去往河南。后在一次与清兵作战时，郭秉钧不幸中炮身亡。